Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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