Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Dsg1bQ7TSF1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms