Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms