Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mkrn3Q60764 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Mkrn3Q60764 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms