Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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