Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms