Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
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Gtpbp6Q3U6U5 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms