Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms