Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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