Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Irx1P81068 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Irx1P81068 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms