Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc13P50207 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc13P50207 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc13P50207 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Hoxc13P50207 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxc13P50207 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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