Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PtpreP49446 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PtpreP49446 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PtpreP49446 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PtpreP49446 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PtpreP49446 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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