Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms