Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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Ccl20O89093 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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Ccl20O89093 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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