Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm17190V9GX38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17190V9GX38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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