Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Homer1Q9Z2Y3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms