Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crlf3Q9Z2L7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms