Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms