Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip6Q9Z1Y4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms