Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ilf3Q9Z1X4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms