Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stk39Q9Z1W9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stk39Q9Z1W9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms