Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs4Q9Z1T2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs4Q9Z1T2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms