Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms