Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms