Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek4Q9Z1J2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms