Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf1Q9Z1B8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf1Q9Z1B8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms