Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms