Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp5Q9Z131 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Sh3bp5Q9Z131 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms