Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema4fQ9Z123 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema4fQ9Z123 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms