Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NgfrQ9Z0W1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms