Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms