Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms