Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PapolbQ9WVP6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PapolbQ9WVP6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms