Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Carm1Q9WVG6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Carm1Q9WVG6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms