Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin2Q9WVE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pacsin2Q9WVE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms