Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms