Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stub1Q9WUD1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stub1Q9WUD1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms