Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lemd3Q9WU40 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lemd3Q9WU40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lemd3Q9WU40 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms