Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp18Q9WTV6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms