Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms