Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam50bQ9WTJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam50bQ9WTJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms