Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubd1Q9R1K7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms