Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms