Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms