Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod2Q9R0B9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod2Q9R0B9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms