Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmfrQ9R049 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms