Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms