Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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