Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc3Q9QZC1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc3Q9QZC1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms