Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Six6Q9QZ28 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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